Кафедра физического воспитания организована в 1930 году. Первые три года ею руководили Николай Михайлович Эйтнер и Евгений Федорович Ульянов. С 1933 г. кафедрой заведовал Юлий Давидович Брегман. Великолепный специалист, большой пропагандист физкультуры и спорта, он по сути создал кафедру, основы работы которой существуют до сих пор. При нем была введена система аренды спортсооружений, организован при кафедре курс ВК и ЛФК, стали проводиться вечерние тренировочные занятия со сборными командами и ежегодный медицинский осмотр студентов. Все эти годы кафедра была центром методической работы всех вузов г. Иркутска по физической культуре, ВК и ЛФК. С 1941 г. кафедру возглавляли Мария Михайловна Рычкова, Валентина Сергеевна Верховская и Георгий Карлович Бирзин.

 С 1943 г. курс физвоспитания был соединен с кафедрой военно-медицинской подготовки. В процессе обучения все студенты получали документ инструктора по ЛФК и применяли свои знания и умения во всех госпиталях города. Кафедра подготовила более тысячи инструкторов. Велика их заслуга в деле реабилитации больных и раненых бойцов, которым они вернули возможность полноценно жить и трудиться после выписки.

В 1948 году кафедра физического воспитания вновь стала самостоятельным подразделением вуза, её возглавил Виктор Павлович Пхайко. С ним связана целая эпоха физкультурно-массовой и спортивной жизни нашего вуза. В период его руководства (с 1948 по 1977 год) кафедра значительно укрепила свою материальную базу. В 1959 году был организован спортивный клуб "Медик", на берегу Иркутского водохранилища открыт спортивно-оздоровительный лагерь. В 1961 году построена лыжная база в пади Топка. В 1963 году кафедра переехала в новый, в самый большой в городе, спортивный зал, где первым спортивным мероприятием был тур чемпионата СССР среди женщин по волейболу. В головном корпусе института построен стрелковый тир. В 1967 году под спортивный зал кафедре передается первый этаж здания синагоги. Улучшение материальной базы сделало возможным привлечь к работе классных специалистов  и создать великолепный коллектив преподавателей-единомышленников. На курсе ВК и ЛФК - это кандидаты медицинских наук Смолькова О.В. и Гинст В.П. Среди преподавателей по физвоспитанию - Азаренок М.Б., Полодухина В.А., Бахарев В.И., Захаров А.С., Бормашев А.В., Беляев А.В., Караченцев В.И., Бородай А.И. и др. Под их руководством сборные команды нашего вуза по лыжным гонкам, баскетболу, конькобежному спорту, легкой атлетике, стрельбе из лука и фехтованию становились чемпионами и призерами Минздрава РСФСР.

С 1977 г. год кафедру возглавил Георгий Иннокентьевич Губин, Отличник здравоохранения, мастер спорта по велосипедному спорту. При нем на кафедре активизировалась научная работа, была создана лаборатория спортивной медицины. С 1979 г. кафедрой руководил Михаил Борисович Азаренок - Отличник высшего образования СССР, Отличник физической культуры и спорта РСФСР, судья всесоюзной категории. В эти годы особое внимание было уделено проведению спортивных мероприятий внутри института. С 1981 г. кафедрой заведовал Отличник физической культуры и спорта Валерий Алексеевич Беляев. А с 1984 г. кафедру возглавил кандидат медицинских наук, кандидат в мастера спорта по боксу Михаил Михайлович Колокольцев. В период заведования Колокольцев М.М. защитил докторскую диссертацию. В 1990 г. заведующим кафедрой избран Юрий Аркадьевич Бабенко - Отличник физической культуры и спорта, кандидат в мастера спорта.

В 1992 г. курс ВК и ЛФК становится самостоятельным подразделением вуза. Его возглавила кандидат медицинских наук Галина Иосифовна Булнаева.

С 2008 по 2013 гг. кафедрой руководил кандидат педагогических наук, доцент Проходовский Руслан Ярославович.

В настоящее время кафедрой заведует кандидат педагогических наук, доцент Шохирев Вадим Владимирович - тренер сборной команды юношей ИГМУ по легкой атлетике и борьбе

В состав кафедры входят:

доцент Брель Павел Юрьевич - кандидат педагогических наук, тренер сборной команды ИГМУ по бадминтону, ответственный за учебную и спортивно-массовую работу на фармацевтическом факультете

доцент Демаков Владимир Иванович - кандидат математических наук, тренер сбоной команды ИГМУ по шахматам, ответственный за НИР, НИРС

8 старших преподавателей:

1. Дронина Олеся Александровна - тренер сборной команды ИГМУ по лыжным гонкам, ответственная за учебную и спортивно-массовую работу на стоматологическом факультете

2. Абуздина Алла Алесандровна - тренер сборной команды ИГМУ по легкой атлетике

3. Пошвенчук Борис леонидович - тренер сборной команды ИГМУ по волейболу

4. Куклин Андрей Викторович - тренер сборной команды ИГМУ по баскетболу, ответственный за учебную работу на 1, 3 ,5 курсах лечебного факультета и спортивно-массовую работу с девушками лечебного факультета

5. Тигунцев Сергей Александрович -  тренер сборной команды ИГМУ по борьбе

6. Володько Ольга Александровна    - ответственная за учебную работу на 2 и 4 курсах лечебного факультета  и спортивно-массовую работу с юношами лечебного факультета  

7. Булычева Наталья Александровна - ответственная за учебную работу на кафедре, ответственная за учебную и спортивно-массовую работу на педиатрическом факультете

8. Калашникова Раиса Викторовна - тренер сборной команды ИГМУ по ОФП, ответственная за учебную и спортивно-массовую работу на медико-профилактическом факультете.